原因是同一时间访问系统的人数过多，出现了列表刷新不出来的问题。北京日报客户端显示，今年中秋国庆连在一起，北京、上海等地城市都出现了旅客数量激增现象，在此时很多游客通过12306尝试买票，却发现系统刷新不出来，多次显示“系统忙”。得知这一消息的记者，在早上八点左右尝试了刷新网站，结果一直跳出“尚未登录”的对话框，最终记者也没能买上票。这几分钟时间内，记者就登陆了3次账号，却都没能上去。
对此12306的官方工作人员解释，是同一时间内出现大量订单量导致的。原来每一次有用户在网站上提供购票信息，网站都会生成让用户确认登录的对话框，这样有很多用户同时提供信息，可能会导致系统崩溃。官方表示已经在组织人手对系统进行检修，预计很快会正常运行。
